Στην Μητρόπολή μας ξεκίνησε αμέσως με τη σύστασή της, με άδεια του Μητροπολίτη, η λειτουργία σχολής Βυζαντινής Εκκλησιαστικής Μουσικής. Η Σχολή απέκτησε νομική υπόσταση το 2012, όταν η Ιερά Σύνοδος της Ιεραρχίας της Εκκλησίας της Ελλάδος ενέκρινε το καταστατικό λειτουργίας της.
Στην περιοχή του Ιλίου λειτουργούσε από το 2001 παράρτημα της Σχολής Βυζαντινής Μουσικής της εννιαίας Μητροπόλεως Αττικής, ενώ αρκετοί ναοί παρέδιδαν μαθήματα στα πλαίσια των ενοριακών δραστηριοτήτων τους. Η Σχολή της Ιεράς Μητροπόλεως Ιλίου έρχεται να συνεχίσει αυτή την παράδοση και ταυτοχρόνως να ενώσει όλες αυτές τις προσπάθειες κάτω από τη σκέπη της Ιεράς Μητροπόλεως, με το κύρος που παρέχει η εποπτία της αλλά και το αναγνωρισμένο πτυχίο ιεροψάλτου που η Σχολή αποδίδει στους επιτυχώντες μαθητές της.
Η Σχολή διοικείται από συμβούλιο, με τα εξής μέλη:
Οι σπουδές έχουν πενταετή διάρκεια. Κατά τη διάρκειά τους ακολουθείται το εγκεκριμμένο πρόγραμμα ύλης από το Υπουργείο Παιδείας. Στο τέλος κάθε έτους γίνονται προαγωγικές εξετάσεις, ενώπιον κανονικά σχηματισμένης εξεταστικής επιτροπής.
Οι εγγραφές κατ' έτος γίνονται τον Σεπτέμβριο και τον Οκτώβριο.
Έδρα της Σχολής είναι το Πνευματικό Κέντρο του Ιερού Ναού Κοιμήσεως Θεοτόκου Παλατιανής Ιλίου.